Iskali zdravilo za tuberkulozo

Sedem dijakov Gimnazije Franceta Prešerna je svoje raziskovalno delo pri krožku bioinformatike strnilo v nalogo, s katero so si prislužili srebrno priznanje na državnem tekmovanju mladih raziskovalcev.

Kranj – V Gimnaziji Franceta Prešerna so v letošnjem šolskem letu dijaki lahko obiskovali tudi krožek bioinformatike, pri kateri se računalniške metode uporablja za reševanje bioloških vprašanj. Sedem dijakov se je tako skupaj z vodjo krožka dr. Lukom Auscem z biotehniške fakultete v Ljubljani lotilo raziskovanja, kako izrabiti viruse, ki zajedajo bakterije, za zatiranje človeku nevarnih bakterij. »Z dijaki smo raziskovali, kako se na nivoju DNK virusi prilagodijo na svoje bakterijske gostitelje in nakazali možnosti za bakteriofagno terapijo tuberkuloze. Bakteriofagna terapija pomeni ciljano zdravljenje bakterijskih okužb z naravnimi virusi,« je razložil Ausec.

Zdravljenje s pomočjo virusov po Auščevih besedah ni nič novega, saj to uporabljajo že več kot sto let. »Že vojaki v prvi svetovni vojni so recimo imeli s sabo tovrstne viruse. Če zadeneš pravi virus za določeno infekcijo, deluje.« A zaradi močne farmacevtske industrije so bakteriofage prehiteli antibiotiki in se je danes z njimi mogoče zdraviti le še v nekaterih »eksotičnih« deželah, recimo v Gruziji, na Poljskem ali Rusiji, pravi Ausec in dodaja, da je to ponovno v vzponu v Ameriki, kjer je na voljo dovolj zasebnega kapitala za raziskovanje tega. Mnoge bakterijske bolezni, ki smo jih do nedavnega uspešno zdravili z antibiotiki, namreč postajajo resen zdravstveni problem, ker se pojavlja vedno več bakterij, ki so na antibiotike odporne. Kot ključno prednost virusov pri zdravljenju bakterijskih okužb Ausec navaja, da so virusi v nasprotju z antibiotiki zelo selektivni in določena vrsta specializirano napade samo določeno vrsto bakterije. Antibiotiki pa napadajo širok spekter bakterij, tudi tiste, ki so človeku koristne. »Povzročitelje tuberkuloze v bolnišnici na Golniku recimo zdravijo s kombinacijo treh do petih antibiotikov hkrati. To je zelo invazivna metoda. Virus pa zajeda samo povzročitelja, če zadenemo pravi virus za pravo bakterijo,« je razložil Ausec.

Dijaki so se v svoji raziskovalni nalogi osredotočili na raziskovanje možnosti zdravljenja tuberkuloze z naravnimi bakteriofagi. »Tuberkulozo povzroča bakterija, ki je že naravno odporna na številne antibiotike. Zato smo želeli najti bakteriofage, ki bi bili evolucijsko na molekularnem nivoju prilagojeni na življenje v tej bakteriji in bi jo tako uspešno uničevali,« so pojasnili Maja Udovič, Maša Svoljšak, Lara Pintarič, Luka Blatnik, Aljaž Uršič, Danaja Križaj in Nuša Vehovec. Podatke o DNK zaporedjih virusnih genomov so pridobili v javnih zbirkah podatkov. Z lastnim programom, napisanem v računalniškem jeziku python, so pregledali približno 1100 zapisov o virusnih genomih in tako izločili šest virusov, ki za svojega gostitelja izbirajo bakterijo, ki povzroča tuberkulozo. Upajo, da jim bo to uspelo preveriti tudi s pomočjo kliničnih testov. »To bi morali opraviti v akreditiranem laboratoriju, recimo v bolnišnici na Golniku,« je razložil Ausec. Če bi se njihove teoretične ugotovitve v prihodnosti torej potrdile tudi z laboratorijskimi eksperimenti, bi te viruse nekoč morda lahko uporabili za zdravljenje tuberkuloze, optimistično pravijo dijaki. In še ena prednost zdravljenja z virusi, ki jo navaja Ausec: virusi so poceni, saj jih je zelo enostavno gojiti in jih proizvajati v velikih količinah, njihov rok uporabnosti pa je praktično neomejen.